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Con el fin de asegurar una alta producción y rentabilidad,  el desarrollo de la agricultura intensiva ha estado caracterizado por el uso de variedades genéticamente mejoradas y más productivas , así como un elevado consumo de agua, nutrientes y pesticidas.  Este sistema conduce a la pérdida de biodiversidad microbiana y riqueza de microrganismos benéficos, generando un desequilibrio a favor de microorganismos oportunistas y oxidativos y acelerando de esta manera los procesos degradativos de la actividad microbiana y de las propiedades químicas, físicas y biológicas de los suelos agrícolas.

La consecuencia de lo anterior es una caída del potencial productivo y el rendimiento de los cultivos.

Por todo ello, el uso de microorganismos eficientes y el conocimiento de la forma en que estos interactúan con las plantas y entre ellos dentro del sistema agrícola intensivo debe ser considerado como una estrategia útil y necesaria para ayudar a superar el reto de la agricultura intensiva.

Para ello el conocimiento de la microbiología de suelo, tanto en sus aspectos cualitativos (mecanismos y procesos), como cuantitativos (concentraciones críticas y actuación en espacio-tiempo) debe ser la táctica actual del agrónomo moderno.

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